MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola (Cinara tujafilina) chromosome

Total Repeats: 17007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015662	TAA	2	6	104	109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233114
2	NC_015662	ATT	2	6	227	232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233114
3	NC_015662	GTTC	2	8	277	284	0 %	50 %	25 %	25 %	336233114
4	NC_015662	T	6	6	333	338	0 %	100 %	0 %	0 %	336233114
5	NC_015662	A	7	7	347	353	100 %	0 %	0 %	0 %	336233114
6	NC_015662	TTA	3	9	386	394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233114
7	NC_015662	AGG	2	6	516	521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233114
8	NC_015662	AAAT	2	8	555	562	75 %	25 %	0 %	0 %	336233114
9	NC_015662	A	6	6	564	569	100 %	0 %	0 %	0 %	336233114
10	NC_015662	CGTTT	2	10	575	584	0 %	60 %	20 %	20 %	336233114
11	NC_015662	ACC	2	6	606	611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336233114
12	NC_015662	ATT	2	6	615	620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233114
13	NC_015662	GTA	3	9	623	631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233114
14	NC_015662	AGA	2	6	648	653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233114
15	NC_015662	T	7	7	679	685	0 %	100 %	0 %	0 %	336233114
16	NC_015662	T	6	6	687	692	0 %	100 %	0 %	0 %	336233114
17	NC_015662	ATCA	2	8	703	710	50 %	25 %	0 %	25 %	336233114
18	NC_015662	GTTC	2	8	766	773	0 %	50 %	25 %	25 %	336233114
19	NC_015662	TTG	2	6	809	814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233114
20	NC_015662	AGA	2	6	843	848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233114
21	NC_015662	A	8	8	867	874	100 %	0 %	0 %	0 %	336233114
22	NC_015662	T	8	8	886	893	0 %	100 %	0 %	0 %	336233114
23	NC_015662	GGATT	2	10	904	913	20 %	40 %	40 %	0 %	336233114
24	NC_015662	TAT	2	6	922	927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233114
25	NC_015662	CAA	2	6	941	946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233114
26	NC_015662	A	8	8	965	972	100 %	0 %	0 %	0 %	336233114
27	NC_015662	TAG	2	6	986	991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233114
28	NC_015662	ATT	2	6	1040	1045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233114
29	NC_015662	A	6	6	1089	1094	100 %	0 %	0 %	0 %	336233114
30	NC_015662	T	6	6	1099	1104	0 %	100 %	0 %	0 %	336233114
31	NC_015662	ACT	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233114
32	NC_015662	GAA	2	6	1135	1140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233114
33	NC_015662	TGC	2	6	1173	1178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233114
34	NC_015662	A	8	8	1193	1200	100 %	0 %	0 %	0 %	336233114
35	NC_015662	GAT	2	6	1246	1251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233114
36	NC_015662	TAA	2	6	1257	1262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233114
37	NC_015662	TAC	2	6	1266	1271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233114
38	NC_015662	GA	3	6	1320	1325	50 %	0 %	50 %	0 %	336233114
39	NC_015662	A	8	8	1408	1415	100 %	0 %	0 %	0 %	336233114
40	NC_015662	TGA	2	6	1425	1430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233114
41	NC_015662	A	8	8	1443	1450	100 %	0 %	0 %	0 %	336233114
42	NC_015662	A	6	6	1461	1466	100 %	0 %	0 %	0 %	336233114
43	NC_015662	TAA	3	9	1488	1496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233114
44	NC_015662	T	6	6	1536	1541	0 %	100 %	0 %	0 %	336233114
45	NC_015662	TAT	2	6	1569	1574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233114
46	NC_015662	TTA	2	6	1579	1584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233114
47	NC_015662	T	6	6	1599	1604	0 %	100 %	0 %	0 %	336233114
48	NC_015662	A	6	6	1608	1613	100 %	0 %	0 %	0 %	336233114
49	NC_015662	AGA	2	6	1617	1622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233114
50	NC_015662	TTG	2	6	1625	1630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233114
51	NC_015662	AAATA	2	10	1643	1652	80 %	20 %	0 %	0 %	336233114
52	NC_015662	TA	3	6	1660	1665	50 %	50 %	0 %	0 %	336233114
53	NC_015662	A	6	6	1673	1678	100 %	0 %	0 %	0 %	336233114
54	NC_015662	A	8	8	1694	1701	100 %	0 %	0 %	0 %	336233114
55	NC_015662	A	6	6	1738	1743	100 %	0 %	0 %	0 %	336233114
56	NC_015662	TA	3	6	1768	1773	50 %	50 %	0 %	0 %	336233114
57	NC_015662	T	7	7	1859	1865	0 %	100 %	0 %	0 %	336233114
58	NC_015662	TATTT	2	10	1877	1886	20 %	80 %	0 %	0 %	336233114
59	NC_015662	T	6	6	1884	1889	0 %	100 %	0 %	0 %	336233114
60	NC_015662	ACTTTA	2	12	1897	1908	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336233114
61	NC_015662	A	6	6	1911	1916	100 %	0 %	0 %	0 %	336233114
62	NC_015662	TATAT	2	10	1922	1931	40 %	60 %	0 %	0 %	336233114
63	NC_015662	T	7	7	1939	1945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015662	TTTATT	2	12	1960	1971	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015662	AT	3	6	1974	1979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015662	AT	3	6	1985	1990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015662	AGT	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015662	ATT	2	6	2005	2010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015662	T	6	6	2024	2029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015662	AT	3	6	2061	2066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015662	TTA	2	6	2072	2077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015662	T	8	8	2084	2091	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
73	NC_015662	AT	3	6	2092	2097	50 %	50 %	0 %	0 %	336233115
74	NC_015662	TAA	2	6	2128	2133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233115
75	NC_015662	T	7	7	2135	2141	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
76	NC_015662	AAT	2	6	2175	2180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233115
77	NC_015662	T	8	8	2227	2234	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
78	NC_015662	TAG	2	6	2242	2247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233115
79	NC_015662	TCT	2	6	2319	2324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233115
80	NC_015662	T	7	7	2341	2347	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
81	NC_015662	A	6	6	2361	2366	100 %	0 %	0 %	0 %	336233115
82	NC_015662	T	6	6	2367	2372	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
83	NC_015662	T	8	8	2398	2405	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
84	NC_015662	A	6	6	2406	2411	100 %	0 %	0 %	0 %	336233115
85	NC_015662	T	8	8	2416	2423	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
86	NC_015662	T	6	6	2447	2452	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
87	NC_015662	TTA	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233115
88	NC_015662	T	6	6	2496	2501	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
89	NC_015662	T	8	8	2538	2545	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
90	NC_015662	TATTT	2	10	2558	2567	20 %	80 %	0 %	0 %	336233115
91	NC_015662	T	6	6	2565	2570	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
92	NC_015662	T	6	6	2574	2579	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
93	NC_015662	AAG	2	6	2584	2589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233115
94	NC_015662	T	6	6	2594	2599	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
95	NC_015662	AGTT	2	8	2600	2607	25 %	50 %	25 %	0 %	336233115
96	NC_015662	T	6	6	2606	2611	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
97	NC_015662	TA	3	6	2630	2635	50 %	50 %	0 %	0 %	336233115
98	NC_015662	T	6	6	2637	2642	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
99	NC_015662	AAT	2	6	2666	2671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233115
100	NC_015662	A	7	7	2684	2690	100 %	0 %	0 %	0 %	336233115
101	NC_015662	ATTTT	2	10	2694	2703	20 %	80 %	0 %	0 %	336233115
102	NC_015662	T	6	6	2700	2705	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
103	NC_015662	T	7	7	2707	2713	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
104	NC_015662	T	6	6	2728	2733	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
105	NC_015662	TA	3	6	2752	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	336233115
106	NC_015662	CTTT	2	8	2760	2767	0 %	75 %	0 %	25 %	336233115
107	NC_015662	TGTTT	2	10	2769	2778	0 %	80 %	20 %	0 %	336233115
108	NC_015662	TATTT	2	10	2780	2789	20 %	80 %	0 %	0 %	336233115
109	NC_015662	CA	3	6	2801	2806	50 %	0 %	0 %	50 %	336233115
110	NC_015662	AATT	2	8	2819	2826	50 %	50 %	0 %	0 %	336233115
111	NC_015662	ATTTGT	2	12	2849	2860	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336233115
112	NC_015662	T	7	7	2873	2879	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
113	NC_015662	A	8	8	2955	2962	100 %	0 %	0 %	0 %	336233115
114	NC_015662	CAA	2	6	2966	2971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233115
115	NC_015662	ATA	3	9	3012	3020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233115
116	NC_015662	T	6	6	3038	3043	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
117	NC_015662	T	6	6	3057	3062	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
118	NC_015662	TAAT	2	8	3094	3101	50 %	50 %	0 %	0 %	336233115
119	NC_015662	T	6	6	3118	3123	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
120	NC_015662	T	6	6	3180	3185	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
121	NC_015662	TTC	2	6	3190	3195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233115
122	NC_015662	TCC	2	6	3209	3214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233115
123	NC_015662	CTA	2	6	3229	3234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233115
124	NC_015662	T	6	6	3315	3320	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
125	NC_015662	T	7	7	3338	3344	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
126	NC_015662	ATT	3	9	3384	3392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233115
127	NC_015662	A	6	6	3414	3419	100 %	0 %	0 %	0 %	336233115
128	NC_015662	CAA	2	6	3451	3456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233115
129	NC_015662	AGA	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233115
130	NC_015662	ATA	2	6	3567	3572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233115
131	NC_015662	ATTTT	2	10	3576	3585	20 %	80 %	0 %	0 %	336233115
132	NC_015662	T	8	8	3582	3589	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
133	NC_015662	AAAT	2	8	3611	3618	75 %	25 %	0 %	0 %	336233115
134	NC_015662	CCA	2	6	3663	3668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336233115
135	NC_015662	ATT	2	6	3683	3688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233115
136	NC_015662	A	6	6	3697	3702	100 %	0 %	0 %	0 %	336233115
137	NC_015662	T	6	6	3703	3708	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
138	NC_015662	T	8	8	3757	3764	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
139	NC_015662	A	6	6	3775	3780	100 %	0 %	0 %	0 %	336233115
140	NC_015662	T	8	8	3798	3805	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
141	NC_015662	CCT	2	6	3837	3842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233115
142	NC_015662	GAA	2	6	3847	3852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233115
143	NC_015662	TAT	2	6	3865	3870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233115
144	NC_015662	T	6	6	3870	3875	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
145	NC_015662	TTTAA	2	10	3882	3891	40 %	60 %	0 %	0 %	336233115
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147	NC_015662	T	6	6	3931	3936	0 %	100 %	0 %	0 %	336233115
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271	NC_015662	AT	4	8	7177	7184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_015662	ATT	2	6	7198	7203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_015662	TAT	2	6	7222	7227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_015662	TTA	2	6	7315	7320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_015662	ATTTA	2	10	7332	7341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_015662	T	6	6	7342	7347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_015662	TTAAT	2	10	7357	7366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_015662	TAA	2	6	7370	7375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_015662	ATA	2	6	7379	7384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_015662	TA	4	8	7393	7400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_015662	AT	3	6	11209	11214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_015662	ATT	2	6	11356	11361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_015662	TAA	2	6	11372	11377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_015662	ATA	2	6	11459	11464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_015662	AT	3	6	11505	11510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_015662	AT	3	6	11525	11530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_015662	T	6	6	11536	11541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_015662	ATA	2	6	11542	11547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_015662	A	6	6	11556	11561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_015662	TAA	2	6	11573	11578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_015662	A	6	6	11824	11829	100 %	0 %	0 %	0 %	336233122
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454	NC_015662	TTG	2	6	11878	11883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233122
455	NC_015662	TA	3	6	11897	11902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_015662	ATT	2	6	11932	11937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_015662	TTA	2	6	11941	11946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_015662	A	6	6	11964	11969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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